ساختار شیمیایی L-5-MTHF-Ca به شرح زیر است:

همانطور که مشاهده می شود، L-5-MTHF-Ca از سه جزء اصلی تشکیل شده است: تتراهیدروفولات متیله، ایزومر چرخشی و یون کلسیم. متیله تتراهیدروفولات یک مشتق ویتامین B9 متشکل از اسید p-aminobenzoic با گروه متیل و اسید گلوتاریک است که می تواند در بدن به تتراهیدروفولات کاهش یابد و در نتیجه در فرآیندهای متابولیک سلولی شرکت کند. ایزومر چرخشی مولکولی است که پیکربندی استریو آن ماهیتی چرخشی دارد و از نظر ساختاری با ایزومر چرخشی متفاوت است، اما دقیقاً فرمول شیمیایی یکسانی دارند. یون کلسیم یک یون معدنی مهم است که عملکردهای فیزیولوژیکی مختلفی در بدن دارد، مانند حفظ سلامت استخوان و انتقال عصبی عضلانی.
ساختارL-5-MTHF-Caفراهمی زیستی و زیست فعالی خوبی به آن می دهد و آن را قادر می سازد به طور موثر در فرآیندهای متابولیک در بدن شرکت کند و اثرات پیشگیرانه و درمانی بر طیف وسیعی از بیماری ها داشته باشد. در نتیجه، به طور گسترده ای در داروسازی و مواد غذایی استفاده می شود.
مگنافولاتمی تواند به طور مستقیم جذب شود، بدون متابولیسم، مناسب برای انواع افراد از جمله جهش ژن MTHFR.