کنترل ناخالصی در ترکیب ال-متیل فولات ضروری است، زیرا ناخالصی ها می توانند فعالیت بیولوژیکی را کاهش دهند، سمیت را افزایش دهند و بر اثربخشی بالینی L-متیل فولات تأثیر بگذارند. JK12A ناخالصی اکسیداتیو L-متیل فولات است. جدیدترین یافتهها نشان داد که JK12A بر رشد جنین گورخرماهی تأثیر منفی گذاشته و ضربان قلب و میزان بقا را به روشی وابسته به دوز تغییر میدهد.
مگنافولات در حال حاضر دقیق ترین ماده خام کنترل ناخالصی در ال-متیل فولات است که به عنوان خالص ترین ال-متیل فولات روی کره زمین شناخته می شود.